Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5938A2AEN9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5938A2AEN9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5938A2AEN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5938A2AEN9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5938A2AEN9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm5938A2AEN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm5938A2AEN9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm5938A2AEN9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm5938A2AEN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm5938A2AEN9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5938A2AEN9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms