Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms