Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6268A2A3U9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6268A2A3U9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms