Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1bA1Z198 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms