Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc173A0JLY1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms