Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI67

Frmpd2, FERM and PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd2A0A140LI67 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd2A0A140LI67 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd2A0A140LI67 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd2A0A140LI67 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd2A0A140LI67 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd2A0A140LI67 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd2A0A140LI67 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms