Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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