Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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