Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trbv31A0A075B5J5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv31A0A075B5J5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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