Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc18Q640L5 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms