Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Cpne9Q1RLL3 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms