Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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