Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms