Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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Hoxd9P28357 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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Hoxd9P28357 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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