Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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PcnaP17918 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PcnaP17918 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PcnaP17918 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PcnaP17918 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms