Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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