Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms