Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpusd2Q149F1 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms