Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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