Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SrprbP47758 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms