Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms