Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Opn1mwO35599 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms