Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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