Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
OtofQ9ESF1 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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OtofQ9ESF1 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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OtofQ9ESF1 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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OtofQ9ESF1 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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OtofQ9ESF1 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
OtofQ9ESF1 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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