Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.1 ms