Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ubash3bQ8BGG7 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ubash3bQ8BGG7 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ubash3bQ8BGG7 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ubash3bQ8BGG7 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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