Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms