Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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