Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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