Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Sh3bp1P55194 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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Sh3bp1P55194 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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