Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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Col5a3Q9JLI2 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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Col5a3Q9JLI2 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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Col5a3Q9JLI2 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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Col5a3Q9JLI2 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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Col5a3Q9JLI2 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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Col5a3Q9JLI2 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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Col5a3Q9JLI2 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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Col5a3Q9JLI2 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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