Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RpainQ9CWY9 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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