Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Cpne9Q1RLL3 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms