Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms