Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Pacsin3Q99JB8 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms