Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Trim35Q8C006 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Trim35Q8C006 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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