Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms