Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc18Q640L5 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms