Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RxraP28700 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RxraP28700 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RxraP28700 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RxraP28700 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RxraP28700 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RxraP28700 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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