Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
P10404 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
P10404 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms