Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rabgef1Q9JM13 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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