Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Col5a3Q9JLI2 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Col5a3Q9JLI2 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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