Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim35Q8C006 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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