Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cntn3Q07409 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cntn3Q07409 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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