Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd13P70217 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms