Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms