Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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