Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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