Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
P10404 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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P10404 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
P10404 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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