Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp29Q9ES63 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms